MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cycloclasticus sp. P1 chromosome

Total Repeats: 45148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018697	TC	3	6	7	12	0 %	50 %	0 %	50 %	407715265
2	NC_018697	GAA	2	6	40	45	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407715265
3	NC_018697	CAA	2	6	55	60	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407715265
4	NC_018697	TAA	2	6	96	101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407715265
5	NC_018697	TGA	2	6	102	107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407715265
6	NC_018697	CAAA	2	8	125	132	75 %	0 %	0 %	25 %	407715265
7	NC_018697	AAAAT	2	10	200	209	80 %	20 %	0 %	0 %	407715265
8	NC_018697	A	7	7	268	274	100 %	0 %	0 %	0 %	407715265
9	NC_018697	CGA	2	6	275	280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407715265
10	NC_018697	TAA	2	6	288	293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407715265
11	NC_018697	TTC	2	6	488	493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407715265
12	NC_018697	AACAAA	2	12	499	510	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	407715265
13	NC_018697	GT	3	6	512	517	0 %	50 %	50 %	0 %	407715265
14	NC_018697	T	6	6	519	524	0 %	100 %	0 %	0 %	407715265
15	NC_018697	ATC	2	6	525	530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407715265
16	NC_018697	ACT	2	6	593	598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407715265
17	NC_018697	T	6	6	637	642	0 %	100 %	0 %	0 %	407715265
18	NC_018697	AAAG	3	12	645	656	75 %	0 %	25 %	0 %	407715265
19	NC_018697	AAG	2	6	662	667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407715265
20	NC_018697	AGA	2	6	756	761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407715265
21	NC_018697	TTGG	2	8	779	786	0 %	50 %	50 %	0 %	407715265
22	NC_018697	TGA	2	6	876	881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407715265
23	NC_018697	T	7	7	888	894	0 %	100 %	0 %	0 %	407715265
24	NC_018697	AAG	2	6	1001	1006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407715265
25	NC_018697	ACAAA	2	10	1029	1038	80 %	0 %	0 %	20 %	407715265
26	NC_018697	A	6	6	1061	1066	100 %	0 %	0 %	0 %	407715265
27	NC_018697	TAC	2	6	1078	1083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407715265
28	NC_018697	TCGC	2	8	1130	1137	0 %	25 %	25 %	50 %	407715265
29	NC_018697	TGG	2	6	1209	1214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407715265
30	NC_018697	TTC	2	6	1232	1237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407715265
31	NC_018697	ATTG	2	8	1278	1285	25 %	50 %	25 %	0 %	407715265
32	NC_018697	ATTA	2	8	1322	1329	50 %	50 %	0 %	0 %	407715265
33	NC_018697	TAA	2	6	1513	1518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407715266
34	NC_018697	AGA	2	6	1519	1524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407715266
35	NC_018697	AGA	2	6	1565	1570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407715266
36	NC_018697	TTTA	2	8	1596	1603	25 %	75 %	0 %	0 %	407715266
37	NC_018697	TTA	2	6	1718	1723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407715266
38	NC_018697	ATG	2	6	1773	1778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407715266
39	NC_018697	TTA	3	9	1785	1793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407715266
40	NC_018697	TTA	2	6	1898	1903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407715266
41	NC_018697	T	6	6	1923	1928	0 %	100 %	0 %	0 %	407715266
42	NC_018697	CAA	2	6	1937	1942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407715266
43	NC_018697	TTA	2	6	1951	1956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407715266
44	NC_018697	ATG	2	6	1970	1975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407715266
45	NC_018697	TTG	2	6	1980	1985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407715266
46	NC_018697	AAAAT	2	10	2037	2046	80 %	20 %	0 %	0 %	407715266
47	NC_018697	AGC	2	6	2092	2097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407715266
48	NC_018697	ACT	2	6	2104	2109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407715266
49	NC_018697	TTGA	2	8	2204	2211	25 %	50 %	25 %	0 %	407715266
50	NC_018697	TAA	2	6	2230	2235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407715266
51	NC_018697	GAA	3	9	2405	2413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407715266
52	NC_018697	TGA	2	6	2434	2439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407715266
53	NC_018697	AGT	2	6	2531	2536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407715266
54	NC_018697	TGCT	2	8	2537	2544	0 %	50 %	25 %	25 %	407715266
55	NC_018697	AGA	2	6	2554	2559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407715266
56	NC_018697	TAT	3	9	2575	2583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407715266
57	NC_018697	TA	3	6	2593	2598	50 %	50 %	0 %	0 %	407715266
58	NC_018697	ATA	2	6	2672	2677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407715267
59	NC_018697	ATT	2	6	2702	2707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407715267
60	NC_018697	GC	3	6	2768	2773	0 %	0 %	50 %	50 %	407715267
61	NC_018697	TC	3	6	2803	2808	0 %	50 %	0 %	50 %	407715267
62	NC_018697	ATA	2	6	2811	2816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407715267
63	NC_018697	A	8	8	2879	2886	100 %	0 %	0 %	0 %	407715267
64	NC_018697	A	8	8	2925	2932	100 %	0 %	0 %	0 %	407715267
65	NC_018697	TCT	2	6	2933	2938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407715267
66	NC_018697	ATT	2	6	2989	2994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407715267
67	NC_018697	TGG	2	6	3001	3006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407715267
68	NC_018697	GT	3	6	3036	3041	0 %	50 %	50 %	0 %	407715267
69	NC_018697	AT	3	6	3066	3071	50 %	50 %	0 %	0 %	407715267
70	NC_018697	AAT	2	6	3149	3154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407715267
71	NC_018697	AGTC	2	8	3178	3185	25 %	25 %	25 %	25 %	407715267
72	NC_018697	AG	3	6	3191	3196	50 %	0 %	50 %	0 %	407715267
73	NC_018697	TAA	2	6	3319	3324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407715267
74	NC_018697	CAC	2	6	3355	3360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407715267
75	NC_018697	GC	3	6	3366	3371	0 %	0 %	50 %	50 %	407715267
76	NC_018697	ATT	2	6	3417	3422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407715267
77	NC_018697	GCT	2	6	3442	3447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407715267
78	NC_018697	TG	3	6	3509	3514	0 %	50 %	50 %	0 %	407715267
79	NC_018697	GAT	2	6	3521	3526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407715267
80	NC_018697	T	8	8	3569	3576	0 %	100 %	0 %	0 %	407715267
81	NC_018697	GAC	2	6	3604	3609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407715267
82	NC_018697	GAAA	2	8	3646	3653	75 %	0 %	25 %	0 %	407715267
83	NC_018697	GAA	2	6	3710	3715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407715268
84	NC_018697	A	7	7	3714	3720	100 %	0 %	0 %	0 %	407715268
85	NC_018697	TCA	2	6	3737	3742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407715268
86	NC_018697	TA	3	6	3794	3799	50 %	50 %	0 %	0 %	407715268
87	NC_018697	GAT	2	6	3809	3814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407715268
88	NC_018697	CAT	2	6	3827	3832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407715268
89	NC_018697	TGA	2	6	3862	3867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407715268
90	NC_018697	ATT	2	6	3902	3907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407715268
91	NC_018697	ATCC	2	8	3962	3969	25 %	25 %	0 %	50 %	407715268
92	NC_018697	GCT	2	6	3986	3991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407715268
93	NC_018697	GGTGTG	2	12	4067	4078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407715268
94	NC_018697	TGT	2	6	4081	4086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407715268
95	NC_018697	A	6	6	4154	4159	100 %	0 %	0 %	0 %	407715268
96	NC_018697	A	6	6	4200	4205	100 %	0 %	0 %	0 %	407715268
97	NC_018697	TTA	2	6	4271	4276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407715268
98	NC_018697	AGA	2	6	4351	4356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407715268
99	NC_018697	TAAA	2	8	4401	4408	75 %	25 %	0 %	0 %	407715268
100	NC_018697	ATT	2	6	4433	4438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407715268
101	NC_018697	ATG	2	6	4458	4463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407715268
102	NC_018697	T	6	6	4512	4517	0 %	100 %	0 %	0 %	407715268
103	NC_018697	AG	3	6	4539	4544	50 %	0 %	50 %	0 %	407715268
104	NC_018697	G	6	6	4547	4552	0 %	0 %	100 %	0 %	407715268
105	NC_018697	AT	3	6	4600	4605	50 %	50 %	0 %	0 %	407715268
106	NC_018697	A	7	7	4624	4630	100 %	0 %	0 %	0 %	407715268
107	NC_018697	ACA	2	6	4640	4645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407715268
108	NC_018697	TGA	2	6	4651	4656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407715268
109	NC_018697	TCA	2	6	4712	4717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407715268
110	NC_018697	TTG	2	6	4758	4763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407715268
111	NC_018697	ATC	2	6	4765	4770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407715268
112	NC_018697	AGC	2	6	4846	4851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407715268
113	NC_018697	GA	3	6	4858	4863	50 %	0 %	50 %	0 %	407715268
114	NC_018697	ACG	2	6	4891	4896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407715268
115	NC_018697	AGCAA	2	10	5008	5017	60 %	0 %	20 %	20 %	407715268
116	NC_018697	GAA	2	6	5028	5033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407715268
117	NC_018697	TCG	2	6	5102	5107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407715268
118	NC_018697	TAA	2	6	5124	5129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407715268
119	NC_018697	TTA	2	6	5243	5248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407715268
120	NC_018697	T	6	6	5251	5256	0 %	100 %	0 %	0 %	407715268
121	NC_018697	TTGA	2	8	5276	5283	25 %	50 %	25 %	0 %	407715268
122	NC_018697	TA	3	6	5316	5321	50 %	50 %	0 %	0 %	407715268
123	NC_018697	A	7	7	5326	5332	100 %	0 %	0 %	0 %	407715268
124	NC_018697	GAT	2	6	5357	5362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407715268
125	NC_018697	TTA	2	6	5415	5420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407715268
126	NC_018697	ACA	2	6	5426	5431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407715268
127	NC_018697	AGA	2	6	5455	5460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407715268
128	NC_018697	ATG	2	6	5517	5522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407715268
129	NC_018697	A	7	7	5610	5616	100 %	0 %	0 %	0 %	407715268
130	NC_018697	CCCAA	2	10	5638	5647	40 %	0 %	0 %	60 %	407715268
131	NC_018697	CAA	2	6	5669	5674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407715268
132	NC_018697	AAG	2	6	5862	5867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407715268
133	NC_018697	ATT	2	6	5875	5880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407715268
134	NC_018697	AAG	2	6	5886	5891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407715268
135	NC_018697	CAA	2	6	5903	5908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407715268
136	NC_018697	ACA	2	6	5960	5965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407715268
137	NC_018697	ACA	2	6	6035	6040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407715268
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